Test d'amplification des acides nucléiques pour les MST

Des tests d'amplification d'acide nucléique, également connus sous le nom de NAT ou NAAT, sont utilisés pour identifier de petites quantités d'ADN ou d' ARN dans des échantillons d'essai. Quand il s'agit de tests STD , il existe des NAT disponibles qui peuvent détecter une variété de différents STD. En fait, la plupart des tests d'urine pour les MST sont effectués en utilisant des tests d'amplification d'acide nucléique.

Comment fonctionnent les tests d'amplification des acides nucléiques?

Il existe plusieurs types d'essais d'amplification des acides nucléiques, mais ils reposent tous sur le même principe.

Un NAT utilise une série de réactions chimiques répétées pour faire de nombreuses copies de l'ADN ou de l'ARN que les médecins tentent de détecter. Ces réactions amplifient le signal des acides nucléiques dans l'échantillon d'essai de sorte qu'ils sont plus faciles à identifier. Il est beaucoup plus simple de trouver 10 000 copies d'un gène que 10.

Qu'est-ce que cela a à voir avec les tests STD?

Le processus d'amplification des acides nucléiques bactériens ou viraux n'est pas en soi le test STD . Au lieu de cela, une fois que la quantité d'ADN ou d'ARN a été augmentée dans l'échantillon en utilisant la PCR ou la LCR , des tests plus classiques sont utilisés pour le détecter. Ces tests impliquent généralement une certaine forme d'hybridation d'acide nucléique. Dans ces tests, l'échantillon est sondé avec un brin complémentaire d'ADN ou d'ARN produit artificiellement qui a été étiqueté d'une manière qui le rend facile à détecter. Cela peut aider à l'imaginer comme une lueur dans l'étiquette sombre qui ne colle qu'à un élément d'information très spécifique.

Les tests d'amplification des acides nucléiques sont incroyablement utiles pour les tests STD. Ils permettent aux médecins de détecter un agent pathogène MST même lorsque seulement un très petit nombre d'organismes sont présents. C'est ce type de technologie qui a permis de faire des tests d' urine pour les MST qui étaient auparavant détectables uniquement par frottis.

De plus, puisque les tests d'amplification des acides nucléiques sont incroyablement sensibles à de petites quantités d'ADN viral, ils sont très importants pour le dépistage de l'apport sanguin. Ces tests permettent de détecter de petites quantités de VIH et d'autres pathogènes transmissibles par le sang qui pourraient autrement manquer.

Il existe également des tests d'acides nucléiques non amplifiés disponibles pour certaines MST, telles que la gonorrhée et la chlamydia . Les tests d'hybridation d'acides nucléiques non amplifiés sont plus susceptibles d'être utilisés lorsque de grandes quantités d'ADN (ou ARN) bactérien ou viral sont attendues, comme dans un prélèvement urétral ou dans un échantillon de culture bactérienne . Dans de telles circonstances, aucune amplification n'est nécessaire. Dans ces échantillons, si de l'ADN ou de l'ARN est présent, il devrait être présent en quantités détectables.

Exemple de ce test en action

Les tests d'amplification d'acide nucléique sont des méthodes incroyablement sensibles pour détecter si une bactérie ou un virus est présent dans un échantillon biologique. Quand il s'agit de détecter l'herpès génital chez une personne qui a des symptômes, ces tests constituent une alternative viable à une culture virale . Les cultures virales peuvent être difficiles à réaliser pour certains laboratoires. Contrairement aux tests sanguins d'herpès , un NAT implique toujours la détermination directe si un virus est présent dans l'échantillon plutôt que de rechercher des anticorps anti-herpès.

L'amplification de l'acide nucléique a également permis une expansion du dépistage de la chlamydia et de la gonorrhée dans tout le pays. Maintenant, un tel dépistage peut maintenant être effectué sur des échantillons d'urine au lieu de nécessiter un prélèvement urétral ou cervicovaginal. Il est donc devenu facile de tester un grand nombre de jeunes hommes et de jeunes femmes victimes de MST dans divers contextes cliniques et non cliniques. La collecte d'urine ne nécessite aucune expertise médicale, et les gens sont plus susceptibles d'être prêts à faire pipi dans une tasse que de subir un prélèvement génital.

Les chercheurs ont également utilisé des tests d'amplification d'acide nucléique pour obtenir plus d'informations sur l'ampleur du problème des MST asymptomatiques aux États-Unis.

Des programmes de dépistage à grande échelle basés sur la NAT ont été mis en œuvre dans l'armée, chez les adolescents urbains, chez les hommes ayant des rapports sexuels avec des hommes et dans d'autres groupes à haut risque et à faible risque. Ces tests permettent la détection de MST dans de petits échantillons souvent pris dans le cadre de vastes études de recherche sur la santé de la population.

> Sources:

> Bernstein KT, Chow JM, Pathela P, cadeau TL. Dépistage bactériologique des maladies transmises sexuellement à l'extérieur de la clinique - Implications pour le programme moderne sur les maladies sexuellement transmissibles. Sex Transm Dis. 2016 février; 43 (2 Suppl 1): S42-52. doi: 10.1097 / OLQ.0000000000000343.

> Chow EPF, Walker S, Lire TRH, Chen MY, Bradshaw CS, Fairley CK. Utilisation autodéclarée du rince-bouche et détection de la gonorrhée pharyngée par le test d'amplification de l'acide nucléique. Sex Transm Dis. 2017 octobre; 44 (10): 593-595. doi: 10.1097 / OLQ.0000000000000654.

> Trembizki E, Costa AM, SN Tabrizi, DM Whiley, Twin J. Opportunités et pièges des tests moléculaires pour la détection des agents pathogènes sexuellement transmissibles. Pathologie. 2015 avril; 47 (3): 219-26. doi: 10.1097 / PAT.0000000000000239.