La propagation rapide des infections par le virus de l'hépatite C explique la variation génétique générale
Il existe actuellement 11 souches génétiques (génotypes) du virus de l'hépatite C (VHC) dans le monde, bien que la prévalence la plus élevée soit observée avec les génotypes 1 à 7. De plus, chaque génotype peut être subdivisé en sous-types spécifiques, sont classés numériquement (par exemple, génotype 1 ou 1b du VHC).
Le génotypage est considéré comme essentiel car il aide les médecins à déterminer quels médicaments fonctionneront le plus efficacement pour votre virus spécifique (ou les virus si vous êtes infecté par plus d'un génotype du VHC).
Le processus d'identification ne nécessite rien de plus qu'un simple test sanguin, dont l'échantillon est analysé à l'aide d'une technologie connue sous le nom de test de réaction en chaîne de la polymérase (PCR) .
Génotype 1
Le génotype 1 est le génotype le plus commun en Amérique du Nord et en Europe et compte pour près de 80% de toutes les infections aux États-Unis. Les infections de génotype 1 sont considérées comme les plus difficiles à traiter, bien que les nouveaux antiviraux à action directe les taux chez les patients nouvellement traités et les patients déjà traités. Le génotype 1 du VHC peut être décomposé en sous-types 1a, 1b et 1c.
Génotype 2
Le génotype 2 est le deuxième génotype de VHC le plus répandu aux États-Unis, représentant environ 10% de l'ensemble des infections. Avant l'introduction des AAD, c'était l'un des génotypes les plus faciles à traiter, les patients ayant 80% de chances d'obtenir une réponse virale soutenue (RVS) compatible avec un traitement curatif. Aujourd'hui, ce chiffre est plus proche de 90% chez de nombreux patients précédemment traités et aussi élevé que 99% chez les patients nouvellement traités.
Le génotype 2 a également trois sous-types principaux: 2a, 2b et 2c.
Génotype 3
Le génotype 3 est endémique en Asie du Sud-Est et inégalement réparti en Australie, en Inde et dans d'autres parties de l'Extrême-Orient. On estime qu'environ 6% des Américains ont le génotype 3 du VHC, qui peut se décomposer en deux sous-types principaux: 3a et 3b.
Génotype 4
Le génotype 4 est le plus répandu en Afrique, au Moyen-Orient et dans plusieurs pays d'Europe de l'Est. L'Egypte a un nombre particulièrement élevé de personnes infectées par le génotype 4, ainsi que la plus grande population de VHC dans le monde. Le taux élevé d'infections au VHC dans ces régions explique en grande partie la grande diversité génétique du virus, qui comprend les sous-types 4a, 4b, 4c, 4d et 4e.
Génotype 5
Le génotype 5 est le plus souvent observé en Afrique australe et est considéré comme ayant une petite variation génétique avec un sous-type principal: 5a.
Génotype 6
Le génotype 5 est commun dans le sud de la Chine, à Hong Kong et dans d'autres pays d'Asie du Sud-Est. Comme le génotype 5, il existe un sous-type principal: 6a.
Génotype 7
Le génotype 7 a été ajouté aux bases de données publiques en 2014 et a jusqu'à présent été identifié en Thaïlande et en République démocratique du Congo. Il a un sous-type principal: 7a.
En outre, les génotypes 9, 10 et 11 ont été identifiés, bien que les infections aient été relativement isolées au Vietnam et dans certaines parties de l'Indonésie.
Traitement du VHC par génotype
Avec l'avènement des antiviraux à action directe, les patients ont une gamme croissante d'options de traitement contre le VHC. Actuellement, la Food and Drug Administration des États-Unis a approuvé les AAD suivants pour les patients infectés par les génotypes 1 et 4 du VHC:
- Daklinza (daclatasvir) : VHC de génotype 3
- Harvoni (sofusbuvir + ledipasvir) : génotype 1 du VHC
- Sovaldi (sofusbuvir) : génotypes 1, 2, 3 et 4 du VHC
- Technivie (ombitasvir + paritaprevir + ritonavir) : génotype 4 du VHC
- Viekira Pak (ombitasvir + paritaprevir + ritonavir co-emballé avec du dasabuvir) : génotype 1 du VHC
- Olysio (siméprévir) : génotype du VHC 1
- Zepatier (grazoprévir + elbasvir): génotypes 1, 4 et 6 du VHC
Sources:
Rockstruh, J. "Résumé de l'EASL 2015 pour l'hépatite C Tout traitement oral de l'AAD du VHC en cours d'optimisation: encore beaucoup à apprendre." 50ème réunion de l'Association européenne pour l'étude du foie (EASL). 22-26 avril 2015; Vienne, Autriche.
Centre national d'information sur les maladies digestives. "Hépatite chronique C: gestion actuelle des maladies".
Département des Anciens Combattants des États-Unis. "Génotype de l'hépatite C."