Les souches recombinantes émergentes continuent de défier les chercheurs
L'un des principaux obstacles au traitement ou au développement d'un vaccin efficace contre le VIH est la grande diversité génétique du virus lui-même. Alors que les virus qui utilisent l'ADN à double brin pour se répliquer sont relativement stables, les rétrovirus tels que le VIH reculent dans leur cycle de réplication (en utilisant de l'ARN monocaténaire) et sont beaucoup moins stables. Il en résulte que le VIH est très susceptible de subir des mutations , en fait environ un million de fois plus fréquemment que les cellules utilisant l'ADN.
À mesure que la diversité génétique du virus s'élargit et que différents sous-types viraux se transmettent de personne à personne, le matériel génétique mixte peut créer de nouveaux hybrides du VIH. Alors que la plupart de ces hybrides meurent, les quelques survivants présentent souvent une plus grande résistance à la thérapie anti-VIH et, dans certains cas, une progression plus rapide de la maladie.
La variabilité du VIH crée donc quelque chose d'une «cible mouvante» pour les chercheurs, avec de nouvelles souches recombinantes (génétiques combinées) capables de résister ou d'échapper complètement aux agents neutralisants. Certains, comme la souche A3 / 02 identifiée par les chercheurs suédois en 2013, sont capables d'épuiser les défenses immunitaires d'une personne beaucoup plus agressivement que les souches connues auparavant.
Qu'est-ce que le VIH-1 et le VIH-2?
Il existe deux types de VIH: le VIH-1 et le VIH-2. Le VIH-1 est considéré comme le type prédominant, représentant la grande majorité des infections dans le monde, tandis que le VIH-2 est beaucoup moins répandu et principalement concentré dans les régions de l'Afrique de l'Ouest et du Centre.
Bien que ces deux types de VIH puissent conduire au SIDA , le VIH-2 est beaucoup plus difficile à transmettre et beaucoup moins virulent que le VIH-1.
Dans chacun de ces types de VIH se trouvent un certain nombre de groupes, de sous-types («clades») et de sous-sous-types. Sans aucun doute, d'autres sous-types et souches recombinantes seront découverts à mesure que la propagation mondiale du VIH se poursuivra.
Groupes VIH-1 et sous-types
Le VIH-1 est divisé en quatre groupes: Groupe M (signifiant «majeur»); Groupe O (signifiant "aberrant", ou au-delà où d'autres groupes sont vus); et Groupe N (signifiant "non-M" et "non-O"); et Groupe P (signifiant "en attente"). Les quatre groupes différents sont classés selon les quatre différents virus de l'immunodéficience simienne (SIV) qui étaient connus pour être transmis des singes ou des chimpanzés à l'homme.
Groupe VIH-1 M
Le groupe M du VIH-1 a été le premier groupe à être identifié et représente aujourd'hui environ 90% des cas de VIH dans le monde et peut être trouvé pratiquement partout dans le monde. Au sein de ce groupe se trouvent 10 sous-types, qui peuvent être stratifiés, entre autres, par leur répartition géographique et leur impact sur différents groupes à risque .
- Sous-type A: observé en Afrique de l'Ouest et affectant principalement les hétérosexuels et les consommateurs de drogues injectables (UDI).
- Sous-type B: le sous-type prédominant en Europe, en Amérique, au Japon, en Thaïlande et en Australie, représentant presque toutes les infections en Amérique du Nord et environ 80% en Europe. Les infections surviennent davantage chez les hommes ayant des rapports sexuels avec des hommes (HSH) et chez les CDI que chez les hétérosexuels.
- Sous-type C: décrit comme le sous-type de VIH le plus répandu, représentant 48% de toutes les infections dans le monde, principalement hétérosexuel et principalement en Afrique subsaharienne, en Inde et dans certaines parties de la Chine.
- Sous-type D: isoler principalement en Afrique orientale et centrale.
- Sous-type E: un sous-type uniquement vu sous une forme recombinante avec sous-type A.
- Sous-type F: parmi un plus petit pourcentage d'infections observées en Afrique centrale, en Amérique du Sud et en Europe.
- Sous-type G: parmi un plus petit pourcentage d'infections observées dans certaines régions d'Afrique et d'Europe.
- Sous-type H: parmi un plus petit pourcentage d'infections observées en Afrique centrale.
- Sous-type J: observé en Afrique du Nord, centrale et occidentale et dans les Caraïbes
- Sous-type K: limité à la République Démocratique du Congo (RDC) et au Cameroun.
Groupe VIH-1 O
Le groupe O du VIH-1 a été découvert en 1990 et ne représente que 1% des infections dans le monde.
Ce groupe VIH est isolé au Cameroun et dans les pays africains voisins.
Groupe VIH-1 N
Le VIH-1 groupe N a été découvert en 1998 et, encore une fois, n'a été vu au Cameroun avec moins de 20 cas documentés à ce jour.
Groupe VIH-1 P
Le VIH-1 Groupe P est un type rare de VIH, identifié pour la première fois chez une femme du Cameroun en 2009. Il peut se différencier des autres groupes VIH dans la mesure où ses origines ont été liées à une forme de SIV trouvée chez les gorilles occidentaux. Bien que la classification "P" soit destinée à déduire un statut "en attente" (c'est-à-dire en attente de confirmation d'une infection supplémentaire), un deuxième cas documenté a été identifié en 2011 chez un Camerounais.
Groupes VIH-2
Bien que des cas de VIH-2 aient été identifiés ailleurs, les infections sont presque exclusivement observées en Afrique. Il existe actuellement huit groupes VIH-2, bien que seuls les sous-types A et B soient les seuls considérés comme épidémiques. On croit que le VIH-2 a traversé des espèces d'un type de SIV affectant le singe mangabeys fuligineux directement aux humains.
Le groupe A du VIH-2 est principalement observé en Afrique de l'Ouest, bien que les voyages internationaux aient mené à une petite poignée de cas documentés aux États-Unis, en Europe, au Brésil et en Inde. En revanche, le groupe B du VIH-2 a été confiné dans certaines parties de l'Afrique de l'Ouest.
Sources:
Sharp, P. et Hahn, B. "Origines du VIH et de la pandémie du SIDA". Cold Springs Harbor Perspectives en médecine. Septembre 2011; 1 (1): a006841.
Palm A .; Esbjörnsson, J .; Månsson, F .; et al. "Progression plus rapide du SIDA et des décès liés au SIDA chez les personnes séroincidentes infectées par le VIH-1 A3 / CRF02_AG recombinant par rapport au sous-sous-type A3." Journal des maladies infectieuses. 1er mars 2014; 209 (5): 721-728.
Vallari, A .; Holzmayer, V .; Harris, B .; et al. "Confirmation du groupe P punitif-1 au Cameroun." Journal de Virologie. Février 2011; 85 (3): 1403-1407.
Abécasis, A .; Wensig, A .; Paraskevis, D .; et al. «La distribution du sous-type du VIH-1 et ses déterminants démographiques chez les patients nouvellement diagnostiqués en Europe suggèrent des épidémies très cloisonnées.» Rétrovirologie. 14 janvier 2013; 10: 7; doi: 10.1186 / 1742-4690-10-7.